Multiple Alignment with all H1 protein sequences

		
MUSCLE (3.8) multiple sequence alignment


H1.3|ClusterXIX|protein      MPAAKSAAKPVTKKAAPSHPPYKQMIADALKG-QWRKGLSVLAINKMIFSEHKDLGPRHE
H1.4|ClusterXV|protein       MPAAKSAAKASPKKAAPSHPPYKQMIADTLKG-QGRKGLSLIAISKMISAEQKNLGPRHE
H1.t|ClusterI|protein        --MAPTTATK--AK-APARPSFAVMVKKAIANLKERNGSSRQAIEKYIVANF-GV-EKTG
H1.1|ClusterVII|protein      MPASPKKATKVAAK-KSDHPTYHVMVAAAIVALAERSGSSRQAIEKYILANYNGV-EKGS
H1.2|ClusterII|protein       MPASPKKATKVVAK-KADRPSYNVMVAAAIVALKERSGSSRQAIEKYIIANYDGV-DKGS
                                : . *.    *  . .*.:  *:  ::     *.* *  **.* * ::  .:  .  

H1.3|ClusterXIX|protein      TSLKLALKRGIEDGSFVKVKGVGLNGSFKLPTPVK-AAPAAK------------------
H1.4|ClusterXV|protein       TSLKLALKRGIEDGSLVKVKGVGLAGSFKLPAPVK-AAPAVK-------------KAPAA
H1.t|ClusterI|protein        HHLRLALKKGVEAGSLIQAKGVGANGSFKLKKVVEPKKPAKKVLKKKAPAKKATATKKKV
H1.1|ClusterVII|protein      HHLKKALKTGVEKGNLVQTKGTGASGSFKIKKA---EKPAAKPKV--------------A
H1.2|ClusterII|protein       HFLKKALKSGVEKGTLVQTKGIGASGSFKIKKA---EKPAAKPKVEKPAAKKPAAKKPAA
                               *. *** *:* *.:::.** *  ****:        ** *                  

H1.3|ClusterXIX|protein      -----KAPAAKKASVKKTAAKNSPVKK-AAKKPAAKKSVPV--------KKTATKKPAAK
H1.4|ClusterXV|protein       KKPAAKKPAAKKAPVKKAAAKKSPVKKAAAKKPAAKKTVVVKKAAA---KKPAAKKPAAK
H1.t|ClusterI|protein        TKKVPKVSAGKKATATKKA----PAKKTAAAKPAAKKAAAPKAAAKA--KTVVKAKPVKK
H1.1|ClusterVII|protein      AKPAAKKPAAKKVTATKKVAAKKPAAKTVVKKTATKKAASPKKVV----KKVAAKKPAAK
H1.2|ClusterII|protein       KKPEAKKPAAKKTTATKKPVAKKVVKKTVVKKTATKKAASPTKKAVSPKKKVVAKKPVVK
                                  * .*.**....*       . * .. *.*:**:.          *. .  **. *

H1.3|ClusterXIX|protein      KAAKKTGKK
H1.4|ClusterXV|protein       KAAKKTGKK
H1.t|ClusterI|protein        AK-------
H1.1|ClusterVII|protein      KTAKKTGKK
H1.2|ClusterII|protein       KAAKKTGKK